В 2020 году значительная часть жалоб со стороны граждан и организаций на решения и действия должностных лиц Новосибирской таможни, направленных руководству таможни, была удовлетворена, тогда как судебные споры с участием таможни были рассмотрены в пользу обратившихся в суд всего в 10 % случаев.